Het pakket lange-termijn-maatregelen bestaat voornamelijk uit een MIRT-verkenning. Naast een aanpak van de problemen op de weg bekijkt het programma de mogelijkheden om het gebruik van de trein op de lange termijn te verbeteren. Het programma sluit hierbij aan bij Toekomstbeeld OV 2040. Dit is een uitwerking van het OV-netwerk op nationaal en regionaal niveau. In de landelijke uitwerking van het spoornetwerk zijn inmiddels de belangrijkste bouwstenen geselecteerd op basis waarvan het spoornetwerk 2040 wordt uitgewerkt en doorgerekend. Hierbij wordt voor de A2 corridor vooralsnog uitgegaan van optimale benutting van de bestaande capaciteit. Dat leidt tot kortere reistijden en met name tussen Utrecht-Den Bosch-Tilburg-Breda tot een hogere frequentie van intercity’s. Ook wordt gekeken naar een andere lijnvoering.